Semasa hidupnya, ia menimba ilmu pada para ulama yang ada di kawasan Hadramaut, Ahwar, Aden, dan wilayah sekitarnya.
Selain menimba ilmu pada para ulama secara tradisional, diketahui beliau juga pernah menimba ilmu di sekolah sampai lulus Universitas Aden untuk Jurusan Tarbiyah.
Kiprahnya mulai tampak saat membuka puluhan pondok pesantren di berbagai pelosok negeri Yaman dengan menggabungkan sistem akademik modern dan pendidikan tradisional.
Muridnya pun banyak, tersebar di berbagai penjuru Yaman, termasuk para sarjanawan dan cendikiawan di negeri para wali tersebut.
Baca Juga: Ijazah Sholawat Penangkal Virus dari Habib Luthfi bin Yahya
Di Indonesia Habib Abubakar pernah membimbing banyak pelajar asal Indonesia, karena memang membuka pendidikan bagi santri asal Indonesia. ***